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三重连太阳系是一个离银河系相当遥远的行星系，拥有着紫色、绿色、红色三颗行星。
    紫色行星的科学家们研究出了一种能够净化人类的负面情感的程序——Z主脑（Z MASTER，分开就是机界31原种），本意是好的，但是由于出错导致了Z主脑程序得出了必须在全宇宙实现机界升华（即将所有生物都变成机械生物）的极端结论。接着悲剧开始了，紫色行星成为了机界升华的第一个牺牲品，连研究Z主脑的科学家普莉玛达与波罗内斯也被佐达化，成了机界四天王。
    机界升华的恐怖弥漫着整个三重连太阳系，红色行星与绿色行星的人们都在努力找出对抗机界升华的办法。就在大家陷入绝望之中时，一丝光明出现了，绿色行星的领导者加印刚出生的儿子拉迪奥，竟然天生便具有佐达抗体。加印根据儿子天生具备的对佐达的净解能力，制造出了与佐达具有相反力量的、闪耀着绿色光芒的G 石。
    而红色行星也没有坐等灭亡，领导者阿贝尔仿照G石的原理制造出了同是佐达抗体、红色的J宝石，同时也根据获得
的加印的儿子拉迪奥的生体情报，制造出了对抗佐达的生体兵器——阿鲁玛（共31名），同拉迪奥一样也具有净解佐达的能力。红色行星上还组成了对抗机界三十一原种的特殊部队，战士的名字是Soldat J，共有三十一人，他们每个人都守护着一名阿鲁玛，并配有一艘巨型战舰J-ARK。
    与机界31原种的激战展开，敌人的实力完全超出了行星上人民的想象，最后soldat J部队几乎被全灭，只残留下伤痕累累的soldat J 002和他的战舰J-ARK，soldat J 002被佐达化成了机界四天王中的比查，而阿鲁玛侥幸逃往地球，被戒道太太收养，成为了戒道几巳。
    终于红色行星与绿色行星都难逃被机界升华的命运。在灭亡前加印把自己的儿子拉迪奥托付给了机械狮加里安，并把自己的意识与人格COPY在了加里安里，加里安带着幼小的拉迪奥飞向地球，将拉迪奥交给了天海夫妇抚养，拉迪奥拥有了地球人的名字——天海护。
     2003年秋,宇宙开发公团的飞行员狮子王凯在试飞中，遇上了飞向地球的未知物体EI-01（正体是统率机界四天王、要将地球进行机界升华的机界司令）。此时加里安赶到，经过一番搏斗，救出了身负重伤的凯。EI-01则冲入地球大气圈，隐藏在了东京地底。
    加里安带着凯回到地球，为了拯救凯的生命，凯的父亲狮子王丽雄利用加里安上面G石的力量，将凯的身体进行了改造，从此凯的生命依靠G石的能量来维持。根据加里安所带来的信息，人类开始积极准备对抗可怕的敌人佐达，地球防卫组织GGG（Gusty Geoid Guard，3G）成立，而加里安则被3G所收纳研究。
    2005年四月，EI-02出现，人类与佐达的战斗终于展开。新生的改造人狮子王凯，与加里安融合后变形成为人形机械GAIGAR，再与Stealth Gao、Liner Gao、Drill Gao进行最终融合（Final Fusion），人类最后的希望——勇者王诞生，它的名字叫GAOGAIGAR！！！
    此时一直是普通小学三年级学生的天海护（拉迪奥），由于佐达的出现使他体内隐藏的能力也觉醒了。只有通过护的净解，才能把佐达化的人类复原。因为这个原因，3G吸收天海护成为特别队员，共同对抗佐达。
    EI-01和手下的机界四天王，不断地将普通人类强制装上佐达金属，使其内心的愤怒与仇恨增幅，从而佐达化成为巨大的机械（EI系列），来对抗 GAOGAIGAR。而凯在与佐达的战斗中不断成长，通过必杀技“天与地”取出佐达核心，然后再由护将其净解复原成人类，这也是人类对抗佐达金属的唯一方法。
    与此同时，3G开发出的人工AI机器人也开始投入使用，冰龙、炎龙以及神出鬼没的忍者机器人布鲁科、还有由凯的叔叔、美国NASA的狮子王雷牙博士开发出来的MIC SOUNDERS13世等先后加入勇者军团，大大提高了战力。而3G的科学家猿头寺耕助与狮子王丽雄等也在加紧对佐达以及天海护的神秘净解进行解析，关于佐达的谜团也被一个个解开，人类在对佐达的战斗中慢慢占据了主动。
    凯在长期与佐达的战斗渐渐无法承受多次使用“天与地”而对身体带来的过重负荷。为此3G终于决定启用秘密开发的超级G工具——黄金之锤（一译毁天灭地锤），对应的可变形成为黄金之锤接合器的机器人黄金玛格也加入了勇者军团。黄金之锤在战斗中发挥了极强的威力，敌人一次次在耀眼的金光中消失得无影无踪。
    终于到了与EI-01决战的时刻，连机界四天王也抵挡不住勇者们必胜的决心。失去了机界四天王的EI-01现出了巨大的正体，强大的能力令勇者军团难以招架，打败它的机率几近为0，但是正如大河指挥官所说的，“成功率只是给人看的，剩下的就用勇气来弥补吧！！！”3G启用了凭着把被G石封印了的高能量收集体爆炸性地解放出来,引发出极限以上的力量的最终武器——弹丸X，通过弹丸X，勇者们发挥出了超越极限的力量，狮子王凯的斗气令天地震动，终于EI-01 抵挡不住黄金之锤的强大威力，在GAOGAIGAR的雄姿后化作一道光柱消失......
    EI-01被消灭了，但人类与Z主脑的战争才刚刚开始。新的敌人、来自三重连太阳系的机界31原种，向地球袭来。连GAOGAIGAR也抵挡不住敌人的强大攻击，3G的基地遭受了毁灭性的打击。此时巨大的白色战舰——J-ARK出现，变形成了巨大的机器人积达王，解除了GAOGAIGAR的危机。原来戒道几巳（阿鲁玛）的能力终于觉醒，他找到了被勇者们打败的机界四天王中的比查与宾治龙，将其还原成了守护阿鲁玛的战士——soldat J 002，宾治龙也成为了战舰J-ARK的主电脑。为了共同对抗机界31原种，G力量与J力量终于站在了一起。
    要打败机界31原种，只有将所有原种的核全部净解。为此在卫星轨道上新生的GGG（Gutsy Galaxy Guard）再次结成，以对抗恐怖的机界31原种。天海护与戒道几巳的身世、三重连太阳系的谜团，也渐渐为人所知。而勇者军团里又再次加入了新的战力，他们是由中国开发的人工AI机器人风龙与雷龙。
    原种们一个个被勇者军团消灭净解，与机界31原种到了决定性的时刻。2005年12月，3G的舰队前往木星，对原种们发动了最后的总攻。勇者们奋力的战斗使得胜利的曙光即将来临，可是狮子王丽雄博士的飞船却不幸被翼原种击中而落木星。在临死前博士看到了许多年前在木星遇难的妻子绊的影像，绊利用木星中不可思议的力量，只余心灵成为了生命体。分隔多年的二人，终于在死后重逢在了一起......
    与此同时，追着父亲的凯和GAOGAIGAR也一起坠落木星，在这里，失去意识的凯，见到了加里昂中保存着的、护的亲生父亲加印的影像。加印把一切都拜托给了勇者，并打开了护最后的封印。借助木星中隐藏着的神秘力量“绝对力量（the power）”，GAOGAIGAR再次复活，浑身闪耀着金色的光芒。脱出木星的GAOGAIGAR和其它勇者一起向剩余的机界三十一原种发动了总攻，眼看胜利即将到来，此时心脏原种的核竟然完成了对“绝对力量”的解析，利用这无穷的力量，被抓获的原种们再次融合在一起，形成了巨大的Z主脑，也就是所有原种的本体。Z主脑通过ES WINDOW向地球发射了大量的佐达胞子，地球危在旦夕......
    Z主脑从连接木星的部分来吸取“绝对力量”的。从木星中心部，吸收回来的“绝对力量”，经过Z主脑的心脏部分，再分配到全身。要打败Z主脑，只有通过绝对力量的集中地，侵入Z主脑的内部，攻击心脏部分。勇者们乘坐J-ARK冲进绝对力量的源流。
    绝对力量其实也是破坏的力量，只懂得一味吸取绝对力量的Z主脑忘记了这一点，戒道和soldat J 002在勇者们的掩护下冲进了Z主脑的心脏，利用绝对力量的急剧膨胀，将Z主脑引至灭亡。被佐达化的地球终于恢复了原貌，阳光再次照耀大地，而积达王也消失在爆炸的闪光中......
    赢得了对Z主脑决战胜利的3G舰队返回地球，本以为和平的生活已经到来。此时令人意想不到的事情发生了，凯的恋人卯都木命竟然吸收了orbit base的能量，成为了机界新种zonuda robot、机械素子，站在了勇者面前。
    机械素子所要实行的，是超越机界升华的物质升华，将一切物质、一切能量升华。由于orbit base的能量被吸走，失去了控制系统，连final fusion都无法进行了。这时勇者军团将自己的人工AI分别移植到各部gao machine上面，帮助凯完成final fusion。gaogaigar终于站在了机械素子面前，面对昔日的恋人，勇者最后的决战展开.......