细节部分捋不顺啊，自走雷怎么回事？

大概情节差不多能懂，但是有些细节怎么都不明白啊。我没看过漫画，也不是死忠粉。
是不是 501原BOSS的死是国防省做的，妓女和巴特队友也是死于国防省，目的是消灭证据和栽赃那个中佐。501方面知情但是无视了，但是把中佐的钱通过素子留下来 。不曾想素子和公安九科执意要洗白中佐，结果真相败露。
但是，想不明白的地方就在素子宿舍那个自走雷身上，她是谁放到素子身边的，目的又是什么？显然自走雷是那个团伙也就是国防省方面的三个自走雷之一，三个当中一个炸了巴特基友，一个埋在坟上，最后一个炸了大臣。炸基友那个没疑问就是国防省的，埋在坟上的到底是501收缴了中佐那个然后埋的，还是国防省埋的呢？两家都有掩盖真相的动机。如果是国防省埋的，大可完全用自走雷换掉遗体然后处理掉遗体以绝后患没必要留证据在下面，但是如果说是是501埋的，素子屋里那个从哪儿来呢？我一直倾向认为屋里那个是501收缴的那个？但是，目的何在呢？501已经默认让军方处理中佐就不应该让素子插手。屋子里杂乱的涂鸦也不懂，还有究竟是谁有意识的蒙蔽了素子的眼睛？目的何在？
关于养母的记忆，究竟501为了转移财产临时安插的，还是一直就有只是被利用了？病毒究竟是有意识的篡改记忆还是无意识的篡改？有意识的话，又是谁在幕后操纵？